После окончания работы через систему прокачивают раствор дезинфицирующего средства, рекомендованного для этих целей. Заполненную раствором систему оставляют на время, указанное в инструкции по применению средства. После окончания дезинфекционной выдержки раствор из системы сливают и промывают ее проточной водой.
Средства, разрешенные для этих целей: Дескосак, Росдез, Вирбаксан, Продез, Виродез-форте Р.